Installez Geany (il est disponible dans les dépôts sous Ubuntu ou Mint...)

Lancez Geany puis allez dans le menu "Construire/Définir les commandes de construction"
Ajoutez une "commande" (sur un bouton 'Etiquette' disponible) et appellez-la "AVR Compile and Build" (ou quelque chose comme ça...) et dans la colonne "Commande" tapez ceci:

AVRcompile %f %e.hex

Et voilà, vous êtes en mesure de compiler les programmes écrits en C et d'obtenir un fichier .hex en un seul clic.